Dependiendo del uso previsto del liofilizante, puede ser necesaria la esterilización entre los ciclos de liofilización. En particular, las aplicaciones farmacéuticas a menudo requieren esterilización entre cada ciclo del proceso de liofilización. Un método común de esterilización es el vapor presurizado, que requiere que la cámara del secador sea un recipiente a presión certificado, clasificado en 2 atmósferas a 131oc.
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